结合国际医学教育基本要求，中心设置临床技能考试中心，引入客观结构化临床技能多站式考试（OSCE），结合各个临床教学阶段的教学目标，中心建立（临床基本技能、临床操作技能、临床综合能力）三段式临床考试制度，以期通过各个阶段的不同考核方式的有机组合，实现对学生的连续观察，客观评价其临床能力与水平：
在临床基本技能基础阶段（即第一阶段），以理论考试为主，辅以实践考核的形式对学生进行考核。诊断学的实践考核以体征模型、标准化病人（SP）、真实病人等重点考核学生对症状体征、中医四诊的掌握情况以及问诊与体格检查的病史采集情况。影像学的实践考核要求学生在规定时间内判读临床影像图片。学生考试合格方准予进入第二阶段。
在临床操作技能阶段（即第二阶段），以本中心的各种演练、操作、示范模具及真实器具对学生的穿刺、导尿、缝合、洗手、针灸、体位摆放、治疗手法、心肺复苏等临床操作技能进行考核，设置以考核基本诊疗技术与各学科基本操作技能为目的的考站试题，评价学生的临床操作技能。学生考试合格方准予进入第三阶段。
在临床综合能力（即第三阶段），依据国际医学基本要求，采用“标准化病人”等，全面推行客观结构化临床技能多站式考试（OSCE），重点考核学生的病史采集、中医四诊、文献采集、临床思维及处理能力等。学生考核合格方准予毕业。
学生实验成绩考评采用平时实验成绩与期末实验考试成绩相结合的办法进行，平时实验成绩占20-30%，以实验操作、实验能力、实验结果及实验报告为主要依据，期末实验考试成绩占70-80%。同时，为鼓励学生在实验中有所创新，凡在实验中有所创新者实验总成绩增加5%，多次创新者总成绩增加10-20%。建立合理的实验成绩登记和网络建档制度。