中心建立了一整套评价体系，出台《福建中医药大学临床技能教学中心实验教学质量监控管理制度》，对各门实践课程的教学质量进行监控。学校教务部门通过老教授教学督导组对教师的教学情况经常进行巡视和抽查，并利用教务管理系统要求学生对每一门课的教学效果及主讲教师履行职责的情况进行网络评估；学校教学督导组经常深入课堂听课，召开学生座谈会，了解实验教学具体情况，并及时向任课教师反馈信息，指导教师进一步搞好实践教学改革；中心领导在深入了解课程进展情况的基础上，敦促各课程组定期或不定期地进行实践教学研讨，扬长避短，保证实践教学高质量运行。